桃最普遍应用的砧木是山桃与毛桃。
1、山桃：耐寒力和耐旱力均强，主根发达，是北方桃产区应用最广泛的砧木品种。嫁接亲和力较强，成活率高，生长健壮。但其不耐湿，在地下水位高和黏重土壤上生长不良，易发生根瘤病、颈腐病和黄叶。
2、毛桃：耐湿力强，适于我国南方的温暖多湿气候，根系发达须根多，也具有较强的耐寒和耐旱能力。嫁接亲和力强，成活率高，结果较早。在黏重和通透性差的土壤上易罹流胶病。近年由于耕作条件的改善，北方一些桃产区也有用毛桃砧木的。
3、毛樱桃：作为矮化砧木，加拿大应用较早。20世纪70年代后期大连农业科学研究所，江苏、浙江、北京、上海等科研院所的观察，认为毛樱桃矮化作用明显，与桃亲和力较强，结果早，树体无徒长现象，但其不耐湿；浙江省农业科学院用作中间砧，同样有矮化作用。目前毛樱桃都是野生种或半野生种，生态类型多，在不同地区反映也有不同，如陕西接黄桃出现在第四年不亲和，镇江嫁接成活率低，仅10%，浙江发现有早衰现象等。故还待进一步加以研究。
其他用作桃砧木还有很多，如扁桃、陕甘山桃、甘肃桃、李、杏、寿星桃、欧李、砂樱桃、榆叶梅等，均是具有特色的砧木。如寿星桃作砧木，树体矮小；甘肃桃作砧木，树体根系发达，生长健壮，尤其是抗瘤蚜和线虫。
另外，由于桃树在盐碱地栽培易缺铁失绿，根瘤线虫为害严重，不能重茬。因此，20世纪40年代开始，些国家开始进行桃树砧木育种。目前已选育出一些具有特殊用途的砧木，很多已应用于生产。如：
GF305：法国1945年从Montreuie地方古老品种中选育出来的品种，主要应用于欧洲，种子繁殖。对钙含量高的碱性土壤适应能力强。
西伯利亚C：加拿大从中国北部收集的桃实生苗中选育出来的品种。1967年育成。用其作砧木，树体矮化，早果性能好，落叶早，芽的耐寒力强。
筑波6号：优良的桃砧木品种，红叶。作为砧木嫁接后，苗木根系发达，须根多，木质化程度高，成苗可形成很多花芽，抗涝能力强，且抗盐能力较普通毛桃强。
GF677：法国用扁桃和桃进行杂交选育而成，营养紧殖，对含钙量高的碱性土壤忍耐力强，其忍耐力与扁桃相似，能重茬栽培。
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